Experiencia con el Biofire FilmArray® para meningitis/encefalitis infecciosa en una institución de alta complejidad en Bogotá, Colombia / Experience with the Biofire FilmArray® for infectious meningitis/encephalitis in a high complexity institution in Bogotá, Colombia

Introducción: La meningoencefalitis infecciosa (MEI) es una emergencia neurológica con importante morbimortalidad. El panel Biofire FilmArray? para meningitis/encefalitis (FAME) en el líquido cefalorraquídeo (LCR) ha demostrado ser una valiosa herramienta para el diagnóstico etiológico de la MEI, facilitando una terapia antimicrobiana dirigida. El objetivo es determinar el impacto del panel FAME en las decisiones terapéuticas antimicrobianas en pacientes con sospecha de MEI en las primeras 24 horas de la valoración clínica. Pacientes y métodos: Estudio observacional descriptivo que comenta las manifestaciones cínicas, los resultados de neuroimágenes y paraclínicos, y la antibioticoterapia de pacientes con sospecha de MEI. Se realizó un análisis del impacto que tiene el FAME en la terapia antimicrobiana en las primeras 24 horas de la valoración clínica de los pacientes. Resultados: Se incluyó a 44 pacientes. El tiempo promedio para obtener el resultado del panel FAME en el LCR fue de nueve horas, con un 20,4% (9/44) de pruebas positivas. En las primeras 24 horas de la valoración clínica, su resultado tuvo impacto en las decisiones terapéuticas antimicrobianas en el 75% (33/44) de los casos. En pacientes con alta sospecha clínica de MEI, el resultado del FAME permitió cambiar la terapia empírica inicial a una dirigida en el 15% (3/20) y suspender la terapia empírica inicial en el 35% (7/20) de los sujetos. En pacientes con baja sospecha clínica de MEI, su resultado permitió que al 25% (6/24) se le confirmara la sospecha y se le iniciara antibioticoterapia dirigida; y que al 70,8% (17/24) se le descartara el diagnóstico y no se le iniciara tratamiento. Conclusiones: El resultado del panel FAME en el LCR tiene alto impacto en la toma de decisiones terapéuticas antimicrobianas en las primeras 24 horas de la valoración clínica. Sin embargo, su interpretación debe hacerse con el contexto clínico, la epidemiología local y otros estudios diagnósticos.(AU)

Introduction: Infectious meningoencephalitis (IME) is a neurological emergency with a significant rate of morbidity and mortality. The Biofire FilmArray® meningitis/encephalitis (FAME) panel for testing in cerebrospinal fluid (CSF) has proven to be a valuable tool for the aetiological diagnosis of IME, facilitating targeted antimicrobial therapy. The aim is to determine the impact of the FAME panel on antimicrobial therapeutic decisions in patients with suspected IME in the first 24 hours of clinical assessment. Patients and methods: This is a descriptive observational study that comments on the clinical manifestations, the neuroimaging and paraclinical findings, and the antibiotic therapy of patients with suspected IME. An analysis was performed to determine the impact of FAME on antimicrobial therapy in the first 24 hours of the clinical assessment of patients. Results: Altogether 44 patients were included. The average time required to obtain the result of the FAME panel for testing in CSF was nine hours, with 20.4% (9/44) of tests yielding positive results. Within 24 hours of clinical assessment, their outcome had an impact on antimicrobial treatment decisions in 75% (33/44) of cases. In patients with a high clinical suspicion of IME, the result of FAME made it possible to change the initial empirical therapy to a targeted therapy in 15% (3/20) of cases and to discontinue the initial empirical therapy in 35% (7/20) of the subjects. In patients with low clinical suspicion of IME, their result allowed 25% (6/24) to have their suspicion confirmed and they were started on targeted antibiotic therapy; in contrast, 70.8% (17/24) had their diagnosis ruled out and were not started on treatment. Conclusions: The result of the FAME panel for testing in CSF has a high impact on antimicrobial therapeutic decisions within 24 hours of clinical assessment. However, it must be interpreted with the clinical context, local epidemiology and other diagnostic studies.(AU)

[Experience with the Biofire FilmArray® for infectious meningitis/encephalitis in a high complexity institution in Bogota, Colombia]. / Experiencia con el Biofire FilmArray® para meningitis/encefalitis infecciosa en una institución de alta complejidad en Bogotá, Colombia.

INTRODUCTION: Infectious meningoencephalitis (IME) is a neurological emergency with a significant rate of morbidity and mortality. The Biofire FilmArray® meningitis/encephalitis (FAME) panel for testing in cerebrospinal fluid (CSF) has proven to be a valuable tool for the aetiological diagnosis of IME, facilitating targeted antimicrobial therapy. The aim is to determine the impact of the FAME panel on antimicrobial therapeutic decisions in patients with suspected IME in the first 24 hours of clinical assessment. PATIENTS AND METHODS: This is a descriptive observational study that comments on the clinical manifestations, the neuroimaging and paraclinical findings, and the antibiotic therapy of patients with suspected IME. An analysis was performed to determine the impact of FAME on antimicrobial therapy in the first 24 hours of the clinical assessment of patients. RESULTS: Altogether 44 patients were included. The average time required to obtain the result of the FAME panel for testing in CSF was nine hours, with 20.4% (9/44) of tests yielding positive results. Within 24 hours of clinical assessment, their outcome had an impact on antimicrobial treatment decisions in 75% (33/44) of cases. In patients with a high clinical suspicion of IME, the result of FAME made it possible to change the initial empirical therapy to a targeted therapy in 15% (3/20) of cases and to discontinue the initial empirical therapy in 35% (7/20) of the subjects. In patients with low clinical suspicion of IME, their result allowed 25% (6/24) to have their suspicion confirmed and they were started on targeted antibiotic therapy; in contrast, 70.8% (17/24) had their diagnosis ruled out and were not started on treatment. CONCLUSIONS: The result of the FAME panel for testing in CSF has a high impact on antimicrobial therapeutic decisions within 24 hours of clinical assessment. However, it must be interpreted with the clinical context, local epidemiology and other diagnostic studies.

TITLE: Experiencia con el Biofire FilmArray® para meningitis/encefalitis infecciosa en una institución de alta complejidad en Bogotá, Colombia.Introducción. La meningoencefalitis infecciosa (MEI) es una emergencia neurológica con importante morbimortalidad. El panel Biofire FilmArray? para meningitis/encefalitis (FAME) en el líquido cefalorraquídeo (LCR) ha demostrado ser una valiosa herramienta para el diagnóstico etiológico de la MEI, facilitando una terapia antimicrobiana dirigida. El objetivo es determinar el impacto del panel FAME en las decisiones terapéuticas antimicrobianas en pacientes con sospecha de MEI en las primeras 24 horas de la valoración clínica. Pacientes y métodos. Estudio observacional descriptivo que comenta las manifestaciones cínicas, los resultados de neuroimágenes y paraclínicos, y la antibioticoterapia de pacientes con sospecha de MEI. Se realizó un análisis del impacto que tiene el FAME en la terapia antimicrobiana en las primeras 24 horas de la valoración clínica de los pacientes. Resultados. Se incluyó a 44 pacientes. El tiempo promedio para obtener el resultado del panel FAME en el LCR fue de nueve horas, con un 20,4% (9/44) de pruebas positivas. En las primeras 24 horas de la valoración clínica, su resultado tuvo impacto en las decisiones terapéuticas antimicrobianas en el 75% (33/44) de los casos. En pacientes con alta sospecha clínica de MEI, el resultado del FAME permitió cambiar la terapia empírica inicial a una dirigida en el 15% (3/20) y suspender la terapia empírica inicial en el 35% (7/20) de los sujetos. En pacientes con baja sospecha clínica de MEI, su resultado permitió que al 25% (6/24) se le confirmara la sospecha y se le iniciara antibioticoterapia dirigida; y que al 70,8% (17/24) se le descartara el diagnóstico y no se le iniciara tratamiento. Conclusiones. El resultado del panel FAME en el LCR tiene alto impacto en la toma de decisiones terapéuticas antimicrobianas en las primeras 24 horas de la valoración clínica. Sin embargo, su interpretación debe hacerse con el contexto clínico, la epidemiología local y otros estudios diagnósticos.

Neurological symptoms associated with SARS-CoV-2 infection in a tertiary hospital in Bogota, Colombia.

Introduction: SARS-CoV-2 infection is an emerging disease that represents a threat to life globally, with more than 179 million confirmed cases and 3 million deaths. In Colombia, where almost 5 million infections and approximately 127 thousand deaths have been reported, it presents a wide variety of neurological manifestations that range from mild to severe symptoms. Objective: This study describes the characteristics of neurological manifestations in patients with COVID-19 in the period March-September 2020 at a tertiary hospital in Bogota. Methods: We performed a cross-sectional descriptive study. We selected patients by non-probability sampling, including all patients attended by the neurology service at our hospital. We included all patients with infection confirmed by RT-PCR test and neurological disease confirmed by tomography, study of cerebrospinal fluid, and clinical manifestations reported in the medical history. We excluded epileptic patients who presented seizures as the only clinical manifestation. Results: In a total of 58 patients, the mean age was 58 years, with 60.3% of patients being men; 65.5% were alert at admission. The main neurological symptom was brain ischaemia, in 36.2%, followed by seizures, in 25.9%. Arterial hypertension was observed in 58.6%. We observed no alterations in the cerebrospinal fluid; the mean hospital stay was 35 days, and 41.4% of patients died. Conclusions: SARS-CoV-2 infection not only affects the respiratory system, but can also cause a range of neurological manifestations ranging from mild symptoms such as headache, dysgeusia, and anosmia to severe complications such as seizures, brain ischaemia/haemorrhage, encephalopathy, or death.

Introducción: La infección por SARS-CoV2 es una enfermedad emergente que representa un peligro para la vida a nivel mundial, con más de 179 millones de casos confirmados y 3 millones de muertes. En Colombia, se han reportado casi 5 millones de personas contagiadas y alrededor de 127 mil fallecidos, presenta una amplia variedad de manifestaciones neurológicas que van desde leves a severas. Objetivo: Describir las características de las manifestaciones neurológicas en pacientes con infección por coronavirus SARS-CoV2 (Covid19) en el periodo marzo ­ septiembre de 2020 en un Hospital de 3er nivel en Bogotá. Metodología: Se trata de un estudio descriptivo tipo corte transversal. Se realizó un muestreo no probabilístico en el que se incluyeron todos los casos atendidos por el servicio de neurología de la institución seleccionada, se incluyeron todos los pacientes con infección confirmada por prueba de RT-PCR y aquellos con enfermedad neurológica documentada por tomografía, estudio de líquido cefalorraquídeo o manifestaciones clínicas registradas en la historia clínica. Fueron excluidos los pacientes epilépticos quienes presenten convulsiones como única manifestación clínica. Resultados: En un total de 58 pacientes, se encontró media de edad de 58 años, con un 60,3% correspondiente al sexo masculino, 65,5% estuvieron alerta, la principal manifestación neurológica fue la isquemia cerebral en un 36,2%, seguida de convulsiones con un 25,9%. La hipertensión arterial estuvo en el 58,6%. No hubo alteraciones en el LCR, el promedio de estancia hospitalaria fue de 35 días y el 41,4% fallecieron. Conclusiones: La infección por SARS-CoV2 condiciona no solo una afección al sistema respiratorio, sino que presenta un amplio espectro de manifestaciones neurológicas que van desde las más leves como cefalea, disgeusia y anosmia, hasta las más graves como convulsiones, isquemia/sangrado cerebral, encefalopatía o muerte.